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Tipo de escarabajo Grebennikovius basilewskyi. Los números junto a las flechas indican los patrones de declaraciones fenotípicas descritos en la sección «PhenoScript: patrones principales de declaraciones fenotípicas». Los números de flecha T1 a T5 muestran partes individuales del cuerpo. crédito: Revista de datos de biodiversidad (2024). doi: 10.3897/BDJ.12.e121562
Uno de los aspectos más bellos de la naturaleza es la infinita variedad de formas, colores y comportamientos que muestran los organismos vivos. Estos rasgos ayudan a los organismos a sobrevivir y encontrar pareja, como la colorida cola de un pavo real que atrae a las hembras o sus alas le permiten volar lejos del peligro. Comprender los rasgos es crucial para los biólogos, quienes los estudian para aprender cómo los organismos evolucionan y se adaptan a diferentes entornos.
Para hacer esto, los científicos primero deben describir estas características con palabras, como decir que la cola de un pavo real es «vibrante, iridiscente y ornamentada». Este enfoque funciona en estudios pequeños, pero cuando se observan cientos o incluso millones de animales o plantas diferentes, es imposible para el cerebro humano realizar un seguimiento de todo.
Las computadoras pueden ayudar, pero ni siquiera las últimas tecnologías de inteligencia artificial son capaces de comprender el lenguaje humano en la medida que los biólogos necesitan. Esto dificulta enormemente la investigación porque, aunque los científicos pueden manejar grandes cantidades de datos de ADN, vincular esta información con los rasgos físicos sigue siendo muy difícil.
Para resolver este problema, los investigadores del Museo Finlandés de Historia Natural, Giulio Montanaro y Sergei Tarasov, junto con sus colaboradores, crearon un lenguaje especial llamado FenoScript. Este lenguaje está diseñado para describir atributos de una manera que tanto los humanos como las computadoras puedan entender. Describir características usando VenoScript es como programar un código de computadora para determinar el aspecto de un organismo.
Phenoscript utiliza la llamada tecnología semántica, que ayuda a las computadoras a comprender el significado detrás de las palabras, de manera muy similar a como los motores de búsqueda modernos saben la diferencia entre una fruta «manzana» y una empresa de tecnología «Apple» según el contexto de su búsqueda.
«Este lenguaje aún se está probando, pero es muy prometedor. A medida que más científicos comiencen a utilizar PhenoScript, revolucionará la biología al poner a disposición grandes cantidades de datos de rasgos para estudios a gran escala, fortaleciendo el campo emergente del fenotipado». Montanaro.
en Artículo de investigaciónpublicado recientemente en Revista de datos de biodiversidadUtilizando el nuevo lenguaje por primera vez, los investigadores crearon fenotipos semánticos para cuatro especies de escarabajos peloteros del género Grebennikovius. Por lo tanto, para demostrar el poder del enfoque semántico, aplicaron consultas semánticas simples a las descripciones fenotípicas generadas.
Por último, el equipo está mirando más allá para modernizar la forma en que los científicos abordan la información sobre las especies. Su próximo objetivo es combinar descripciones de tipos semánticos con el concepto de nanoprismas, «que resumen piezas discretas de información en un gráfico de conocimiento integral».
Como resultado, los datos que pasan a formar parte de este gráfico se pueden consultar directamente, garantizando así que sigan siendo buscables, accesibles, interoperables y reutilizables (FAIR) a través de una variedad de recursos semánticos.
más información:
Giulio Montanaro et al., Descripciones de especies computables y nanoprismas: aplicación de técnicas basadas en ontología a escarabajos peloteros (Coleoptera, Scarabaeinae), Revista de datos de biodiversidad (2024). doi: 10.3897/BDJ.12.e121562
Información de la revista:
Revista de datos de biodiversidad
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